| Свежий номер №36 (413) / Биология in silico Дата публикации: 21.09.2001 Михаил Гельфанд, gelfand@integratedgenomics.ru
Словарь ДНК (дезоксирибонуклеиновая кислота) - полимерная молекула, элементарными единицами которой являются четыре нуклеотида: A, C, G, T. Ген - участок ДНК, кодирующий один белок. Белок - полимер, в построении которого принимают участие 20 аминокислот (на самом деле больше, но другие аминокислоты появляются в результате дополнительной химической модификации). Белки играют основную роль в жизни клетки - формируют ее скелет, катализируют химические реакции, выполняют регуляторные и транспортные функции. В живой клетке каждая молекула белка имеет сложную пространственную структуру (см. рис. 1).
Геном - совокупность всех генов организма или, шире, полная последовательность ДНК. Размер генома человека - 3 миллиарда нуклеотидов, кодирующих 35-40 тысяч генов 1, генома бактерий - от 600 тысяч нуклеотидов/600 генов (внутриклеточные паразиты) до 6-8 миллионов нуклеотидов/5-6 тысяч генов (свободно живущие бактерии). Упражнение: в скольких выпусках журнала «Компьютерра» можно будет опубликовать бактериальный геном, если посвящать этому половину каждого номера? Секвенирование - определение последовательности нуклеотидов во фрагменте ДНК. Именно это имеется в виду, когда в газетах пишут о «расшифровке генома человека». Исследование работы генов в масштабе целых организмов, а также эволюция геномов составляют предмет геномики, а анализ полного набора белков в клетке и их взаимодействий друг с другом - предмет протеомики 2. 1 (обратно к тексту) - А вовсе не сто тысяч, как ожидалось первоначально, ср. «КТ» № 370, i37034. 2 (обратно к тексту) - Иногда говорят о «постгеномной эре». Как правило, в эту фразу не вкладывается никакого разумного смысла, и она носит чисто политический характер, связанный с перераспределением финансирования научных исследований. На самом деле все новые и крайне важные направления вырастают именно из анализа геномной информации, которая и служит фундаментом для дальнейших разработок. Более того, мы только лишь начинаем понимать устройство генома в целом. (См. также «КТ» № 412, Е. Каликинская, «Протеомика против геномики». Л. Л.-М.)
|